يتولى قسم الرقابة الإدارية تنفيذ الاختصاصات التالية :

1. التأكد من مدى الالتزام بمعايير الجودة من خلال تطبيق الإجراءات الإدارية وخطوات تدفق سير العمل ومدى مطابقتها للقرارات واللوائح التنظيمية لها وكذلك التعاميم والقرارات التي تصدرها الجهات المركزية بالدولة.   

2. التأكد من سلامة تطبيق التفويضات الممنوحة لكافة المستويات الإدارية بالهيئة.

3. اقتراح نماذج الخطة وذلك بالتنسيق مع الإدارة المعنية ( إدارة التطوير الإداري والتدريب) .

4. إعداد التقارير الدورية و السنوية بشأن الإجراءات الإدارية الخاصة بالأداء العام بالهيئة وكذلك الإدارات ومراكز العمل و العاملين على نحو مفصل و إحالتها إلى مدير الإدارة تمهيد للعرض للسيد المدير العام لاتخاذ ما يراه مناسبا.

5. دراسة الموضوعات المحالة من السيد المدير العام بشأن التزام العاملين بالقيام بمهام عملهم و المسئوليات المناطة بهم على نحو مهني يضمن تحقيق أهداف العمل فيما يخص الأمور الإدارية.

6. اقتراح وتنفيذ خطة الرقابة الدورية و السنوية اللاحقة للأعمال التي تم تنفيذها و توضيح أهدافها ووسائلها للإدارة و مراكز العمل المعنية فيما يخص الأمور الإدارية.

7. متابعة تنفيذ الخطة التشغيلية و الخطة الخمسية للهيئة مع الإدارات و مراكز العمل المعنية فيما يخص الأمور الإدارية.